В случае аварии, пассажиров защищает прочный кузов с обширными зонами деформации и до 7 подушек безопасности, действие которых дополняется трехточечными автоматическими ремнями безопасности и подголовниками. К другим функциям безопасности относятся передовые электронные системы, призванные смягчить последствия ДТП.

По результатам испытаний Euro NCAP Škoda Octavia получила максимально возможную оценку — пять звезд, что еще раз говорит о гарантиях максимальной безопасности для всех, кто в ней путешествует. В категории «Защита для детей» Octavia набрала 88 процентов всех возможных баллов. Это позволило Octavia занять первое место среди всех протестированных автомобилей. В категории «Защита для взрослых» результат Octavia составил 92 процента.